Chất tạo màu trong mực nhuộm được hòa tan hoàn toàn trong mực theo cách đơn phân tử, các hạt chất tạo màu của nó rất nhỏ và dễ hòa tan trong nước hoặc các dung môi hóa học khác. Cấu tạo như vậy khiến mực nhuộm khó có thể làm tắc đầu phun. Kể cả khi bị tắc thì việc nạo vét vòi phun cũng tương đối đơn giản. Tuy nhiên, chất tạo màu nhuộm của mực nhuộm có một số lượng lớn các hạt ưa nước và dễ hòa tan. Bằng cách này, một khi bản thảo đã in gặp nước, chất tạo màu đã cố định trước đó trên môi trường sẽ bị hòa tan trở lại và lan ra xung quanh theo dòng nước, gây ra hiện tượng quầng sáng nghiêm trọng. Đây là nguyên nhân chính dẫn đến hiệu quả chống thấm nước kém của mực nhuộm. Đồng thời, chất tạo màu của mực nhuộm tiếp xúc trực tiếp với không khí. Dưới tác dụng của ánh sáng và ozon, chuỗi hóa chất của chất tạo màu có thể bị đứt gãy, gây biến màu chất tạo màu và các hiện tượng khác, làm phai bản thảo đã in, ảnh hưởng đến hiệu quả bảo quản.
Cấu trúc của mực bột màu là giống nhau, và chất tạo màu là một số hạt rắn nhỏ. Để làm cho các chất màu rắn này phân bố đều trong mực, chất nhũ hóa sẽ được thêm vào để làm cho chất màu được bọc bằng một thành phần nhựa đặc biệt. Với sự trợ giúp của một lượng nhỏ các hạt ưa nước trên lớp nhựa thông, mực sẽ được nhũ hóa và chất màu sẽ lơ lửng trong mực. Vì chất tạo màu không hòa tan trong nước nên khi bản in gặp nước, chất tạo màu sẽ không di chuyển theo nước và khả năng chống thấm nước của nó đương nhiên được cải thiện đáng kể. Chất tạo màu của mực bột màu nói chung là một khoáng chất được nghiền nát cao, và độ ổn định riêng của nó rất tốt. Ngoài ra, lớp ngoài của chất tạo màu được bao bọc bởi một lớp nhựa thông. Khi gặp ánh nắng và ozon, thứ đầu tiên bị phá hủy là lớp nhựa bên ngoài, còn chất tạo màu bên trong không bị ảnh hưởng nên không dễ bị phai màu.
